人类MHC-Ⅱ类分子是由两条非共价键结合的多肽链组成的异二聚体。α链和β链均系HLA基因表达的产物。包括抗原多肽结合区和Ig样区，由α1、α2、β1、β2四个结构域组成。
MHC-Ⅱ类分子的分布较窄，主要存在于B细胞、单核-巨噬细胞、DC等细胞上，血清、精液及乳汁等体液中也可检测到。胰岛β细胞和甲状腺细胞在病理情况下亦能表达医学教.育网搜集整理。
胰岛素、甲状腺素、雄激素、TNF-α、IFN-γ、IL-1、IL-2、IL-6、GM-CSF等，可促进Ⅱ类分子的表达；而前列腺素、糖皮质激素等则可抑制其表达。